Nach der Errichtung der Sowjetmacht sahen sich die orthodoxen Gemeinden massiven Verfolgungen ausgesetzt: Kirchen und Klöster wurden geschlossen, kirchliches Eigentum beschlagnahmt, Geistliche und Gläubige verhaftet und hingerichtet.
Unter den neuen Bedingungen entstanden in der orthodoxen Gesellschaft unterschiedliche Haltungen gegenüber dem Staat.
Manche kirchlichen Persönlichkeiten versuchten, durch Vereinbarungen mit den Behörden die Möglichkeit öffentlicher Gottesdienste zu erhalten. Andere hielten jede Einmischung des Staatsapparats in Fragen des Glaubens und der Kirchenleitung für unzulässig.
Besondere Bedeutung erlangten die Ereignisse des Jahres 1927, als Metropolit Sergius (Stragorodski), der das Moskauer Patriarchat leitete, eine Erklärung der Loyalität gegenüber der Sowjetmacht veröffentlichte.
Das Dokument rief in kirchlichen Kreisen tiefe Meinungsverschiedenheiten hervor.
Ein Teil der Geistlichen und Laien weigerte sich, den von der Leitung des Moskauer Patriarchats eingeschlagenen Kurs gegenüber dem Staat anzuerkennen. Einige Gemeinden stellten den öffentlichen Gottesdienst ein und führten ihr religiöses Leben im Verborgenen fort.
Diese Gruppen sind unter dem Sammelnamen Wahre Orthodoxe Kirche oder Katakombenkirche in die Geschichte eingegangen.
Die Katakombenbewegung war keine einheitliche, zentral geleitete Organisation. Sie vereinte verschiedene Gemeinden, geistliche Traditionen und Gruppen von Gläubigen, die unter staatlichem Druck ihre religiöse Eigenständigkeit bewahren wollten.
Gerade mit dieser Erfahrung des Widerstands gegen die Unterordnung der Kirche unter die politische Macht verbindet die Apostolisch-Orthodoxe Kirche eine der wichtigsten Linien ihres geistlichen Erbes.
Für die künftigen Gründer der Apostolisch-Orthodoxen Kirche wurde die Erinnerung an die Verfolgungen und an die unabhängigen orthodoxen Gemeinden zur Grundlage der Überzeugung, dass das kirchliche Leben auf Glauben, Synodalität und der freien Entscheidung des Menschen beruhen muss und nicht auf einem staatlichen Zwangssystem.