Durante los primeros siglos del cristianismo se fueron asentando las bases de la doctrina de la Iglesia, de su vida litúrgica y de su ordenamiento canónico.
Tuvieron especial importancia los concilios ecuménicos, en los que se resolvieron cuestiones de cristología, de doctrina, de disciplina eclesiástica y de relación entre las comunidades locales.
Con el tiempo se consolidaron los grandes centros del mundo cristiano, en torno a los cuales se desarrollaron las tradiciones eclesiales de Oriente y de Occidente.
La historia del cristianismo conoció tanto el afianzamiento de la unidad como profundas divisiones. Una de las más importantes fue el progresivo distanciamiento entre el cristianismo oriental y el occidental, que tradicionalmente se asocia con los acontecimientos de 1054.
La Iglesia Ortodoxa Apostólica pertenece a la tradición ortodoxa del cristianismo oriental. Confiesa la fe en la Santísima Trinidad y en las naturalezas divina y humana de Jesucristo, y permanece fiel a la Sagrada Escritura, a la Santa Tradición y a la herencia dogmática de los concilios ecuménicos.
Al mismo tiempo, la Iglesia reconoce el valor espiritual y cultural de la herencia cristiana tanto de Oriente como de Occidente, en la medida en que concuerda con su doctrina ortodoxa.
Según la Confesión de fe de la Iglesia Ortodoxa Apostólica, la única Iglesia de Cristo se manifiesta en una multitud de Iglesias locales y comunidades unidas por la fe, los sacramentos y la acción del Espíritu Santo.
Esta idea está en la base de su comprensión de la unidad eclesial: ante todo como unidad en Cristo, que no se reduce a la existencia de un único centro administrativo.